Les Formations du PRABI-AMSB



Présentation

Le PRABI-AMSB est un des acteur principal de la formation initiale et continue en bioinformatique en France. Depuis sa création, le personnel de la plateforme à ainsi formé plus de 600 personnes, étudiants, enseignants-chercheurs, chercheurs, personnnels techniques, employés du publique et du privé. Nous travaillons en partenariat avec la société Bioscience & co et les différents organismes de formation des tutelles.



Le PRABI-AMSB organise des formations en bioinformatique sur les thèmes suivants:

  • initiation à la programmation (Linux, R, perl)
  • utilisation des ressources de calcul et de stockage (slurm,galaxy etc.)
  • utilisation des outils et des packages de bioinformatique (Stringtie, Trinity, DESeq2, blast, clustalw, cytosczpe etc...)
  • l'analyse de données -omique sous galaxy, Linux et R (RNA-seq: mapping, assemblage de novo, expression différentielle, calling et annotation fonctionelle de variants etc.).

Organisation de nouvelles formations
Nous pouvons organiser des formations sur mesure (intra ou inter labo) en informatique/bioinformatique/biostatistique, n'hésitez pas de nous contacter nous serons heureux d'en discuter avec vous.

Salle de formation du PRABI, Campus LyonTech-la Doua.

Nous disposons dans nos locaux d'une salle de formation entièrement équipée d'ordinateurs portables (financés par la FR BioEEnvis) et d'un système de vidéo-projection destinée à nos formations en bioinformatique d'une capacité de 16 personnes max. La salle de formation du PRABI-AMSB et/ou son équipement sont ouverts à la location (voir Tarification).

Exemple de formations réalisées depuis 2010
  • Formation R (Formation intra/inter, 3 jours) 2010-now
  • Formation galax/RNA-seq (Formation intra,inter, 3 jours) 2010-now
  • Formation RNA-seq de novo - (Formation intra, 3 jours), LEHNA, 2017
  • Formation Linux/RNA-seq - (Formation intra, 3 jours), ENS, 2017
  • Formation R - (Formation intra, 3 jours), LEM, XXXX
Autres formations en bioinformatique :
Sur le site Lyon gerland, le Conseil d'Analyse Numérique (CAN) de la SFR Biosciences organise périodiquement des formations en imagerie (imageJ), analyse R pour les débutants, analyse de données RNA-seq (lien). Ces formations sont destinées en priorité aux membres des unités la SFR Biosciences, mais n'hésitez pas à postuler au cas ou des places se libèrent.